层次分析法是一种用于分析解决多目标、多准则的复杂系统问题的定性分析与定量分析相结合的系统决策分析方法,是复杂系统实现科学化决策的有力工具。文章首先确定作业指挥管理系统的指标体系,对作业指挥管理系统的应用效能进行模糊综合分析和研究,并提出基于AHP和模糊综合评判的方法对其应用效能进行评价,构建应用效能评价模型。数值仿真结果表明：该应用效能评价模型中的判断矩阵具有满意的一致性,作业指挥管理系统的应用效能属于优等,利用最大隶属原则来确定的评判等级较为有效。